Vốn dĩ Nhiên Đăng Phật ngự ở ngôi vị Vạn Phật Chi Tổ, nhưng lại bị Thái Ất chém giết, giáng xuống thành Quá Khứ Phật, mới có chuyện Thích Ca Mâu Ni Phật từ Lão Tử hóa Hồ mà ra, chiếm giữ vị trí hiện tại và trung ương, trở thành Vạn Phật Chi Tổ.
Mà Thích Ca Mâu Ni Phật, chính là vị được gọi là Phật Đà.
Cho nên Tam Thế Phật của Phật Môn, vốn tương ứng với ba vị Đạo Tổ của Phật Môn, lại càng tương ứng với Phật Môn Tam Bảo, tức là Phật, Pháp, Tăng.
Phật Môn Tam Bảo, về bản chất vẫn là được khai sáng từ Tam Thanh của Đạo Môn.
Nói đúng ra thì, Đạo Môn có Tam Bảo trước, sau đó Phật Môn mới có Tam Bảo.
