Mỗi phòng ban đều do Phòng chỉ huy thống nhất quản lý.
Để đối phó với tình hình khủng hoảng có thể xảy ra trong Tinh Thành, Bộ tư lệnh đã thiết lập các căn cứ ở mỗi khu vực của Tinh Thành, được trang bị vũ khí và thiết bị tiên tiến.
So với Hổ Phách và Viện Nghiên cứu Tinh Hồng, lối vào căn cứ của Bộ tư lệnh không có tường rào cao, chỉ dùng hàng rào thép gai để tạo thành rào chắn.
Qua hàng rào thép gai, Phong Kỳ có thể nhìn rõ một lượng lớn vũ khí và thiết bị được bày trên quảng trường của căn cứ.
Đến cổng Nam của Bộ tư lệnh, sau khi được binh lính hỏi thăm và xác minh danh tính, Phong Kỳ đã vào được căn cứ của Bộ tư lệnh và được một người lính trực ở cổng lái xe đưa đến tòa nhà Tổng chỉ huy.